ปรัชญา คือ คุณธรรมนำความรู้ คู่ความสามารถ ฉลาดพัฒนาตนและชุมชน
ปณิธาน คือ คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยกรุงเทพธนบุรี มีปณิธานที่จะผลิตบัณฑิตแพทย์ให้เป็นผู้มี ปัญญา ความรู้ ทักษะ และจิตสำนึกที่ดี ต่อการให้บริการสุขภาพแบบองค์รวม ครอบคลุมทั้งการส่งเสริม สุขภาพ การป้องกันโรค การตรวจวินิจฉัย การรักษา และการฟื้นฟูสุขภาพของบุคคล ครอบครัว และ ชุมชน ยึดมั่นในคุณธรรมและจริยธรรมแห่งวิชาชีพ มีความสามารถในการพัฒนาตนเองและชุมชนได้ อย่างต่อเนื่อง สามารถปรับตนเองให้เข้ากับสถานการณ์ในอนาคตได้อย่างเหมาะสมกับการเปลี่ยนแปลง ด้านความรู้ สังคมและเศรษฐกิจของประเทศ
วิสัยทัศน์ คือ คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยกรุงเทพธนบุรี เป็นสถาบันการศึกษาแพทยศาสตร์ที่ได้ มาตรฐานและมุ่งสู่ความเป็นเลิศระดับประเทศ
พันธกิจ คือ คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยกรุงเทพธนบุรี มีพันธกิจดังนี้
1. ด้านการศึกษา จัดการศึกษาเพื่อผลิตบัณฑิตแพทย์ให้มีความรู้ความสามารถตามเกณฑ์มาตรฐานของประเทศในการให้บริการทางการแพทย์โดยเฉพาะด้านเวชศาสตร์ครอบครัวและเวชศาสตร์ผู้สูงอายุเพื่อ ตอบสนองความต้องการของชุมชน สังคมและประเทศ
2. ด้านการวิจัย ส่งเสริมงานวิจัยให้มีคุณภาพระดับนานาชาติ เพื่อสร้างองค์ความรู้ด้านวิทยาศาสตร์ การแพทย์และด้านอื่นที่เกี่ยวข้องกับความชำนาญของอาจารย์เพื่อเป็นแนวทางในการพัฒนาต่อ ยอดและการนำมาประยุกต์ใช้ในชุมชนและสังคม
3. ด้านการบริการ ให้บริการทางวิชาการด้านการแพทย์และวิทยาศาสตร์สุขภาพเพื่อตอบสนองความต้องการของ ชุมชนและสังคม
4. ด้านการส่งเสริมศิลปวัฒนธรรม ส่งเสริมความรู้ ความเข้าใจในศิลปวัฒนธรรมและภูมิปัญญาท้องถิ่นนของไทยให้แก่นักศึกษาและ คณาจารย์เพื่อเป็นแบบอย่างที่ดีแก่ชุมชนและสังคม
5. ด้านการบริหารและการจัดการ ส่งเสริมการใช้หลักธรรมาภิบาลในการบริหารจัดการ
6. ด้านการแพทย์และสาธารณสุข ให้บริการทางการแพทย์และการสร้างเสริมสุขภาวะด้วยความรู้ทางวิชาการแก่ชุมชนและสังคม บนพื้นฐานสิทธิมนุษยชนและระบบบริการสาธารณสุขของประเทศ
ค่านิยม คือ EKG
E คือ Ethics จริยธรรมในวิชาชีพแพทย์และการดำเนินชีวิตในสังคม
K คือ Knowledge ความรู้ ความสามารถ ที่ทันสมัยในการเป็นแพทย์
G คือ Generosity ความเอื้ออาทร ที่มีต่อผู้ป่วย เพื่อนร่วมงานและสังคม รวมทั้งอาจารย์มีความเอื้อ อาทรต่อศิษย์และศิษย์มีความเอื้ออาทรต่อครูบาอาจารย์ และบุคลากรทุกระดับในมหาวิทยาลัย
หมายเหตุ EKG ยังหมายถึง คลื่นไฟฟ้าหัวใจ หรือ Electro Cardio (Kardio) Graphy ซึ่งหัวใจจะต้องเต้นตลอดเวลา เปรียบเสมือนแพทย์ที่ต้องตื่นตัวอย่างต่อเนื่องตลอดเวลา